购房合同附加协议与主合同相抵触,附加协议有效吗

我前年购买的房子，今年4月30号交楼，但是开发商推迟到6月23才发收楼通知，我们看了以后，他们不能提供工程竣工验收备案表。另主合同说延迟交楼每天按百分之零点零五给违约金，但是附加协议中有一项是说最高赔偿不超过总房价的百分之一，还有就是附加协议中说甲乙双方一致同意删除主合同中的某项条款，然后另写一条与祝合同相抵触的条款，或者写一条对开发商明显有利，而对业主不利的条款，请问这样的条款有法律效力吗，没有备案表我可以拒收楼吗，如果这样的条款有效，那国家定的统一的主合同岂不是没有任何意义， 收起