购房合同已备案,和房地产公司签订的补充协议有效么?需要再备案么?

开发商制作的住房买卖合同中,已包括了合同补充协议,我们签订生效后已经拿去备案了。今天我和房地产公司又签了一个补充还款协议,将原合同中的一次性付款更改为分两次付款,将第一次付款时间定为原要求一次性付款的时间,最后一次付款时间相对推迟。协议为一式二份,请问,这样的补充协议,有效么?