由于历史原因当时没有办房产证,签了一份房屋买卖协议,现在是否有效

您好,合同只要不违反法律强制性规定,是双方的真实意思表示就是有效的。根据您说的情况初步推断您签订的合同是有效的。但是不动产物权的变更是以登记为生较要件的,也就是说没办理房产证不发生物权效力。如果对方反悔可以说房子还是对方的,但是对方得依你们双方之间的合同承担相应的退款责任及违约责任。如果想确定房产物权,请尽快办理房产过户手续。