农,村宅基地只有土地使用证,没有房产证,两层楼房却只按小于房屋建筑面积的土地使用证来置换房屋为什么不以房屋建筑面积来置换了这合理吗?

农,村宅基地只有土地使用证,没有房产证,两层楼房却只按小于房屋建筑面积的土地使用证来置换房屋,我多余建筑三十平方的面积给我9百补偿,然后再让我花3500元来卖他三十平米,我房屋一次性建成十几年了唯一的宅基地,没有翻建违建,为什么不以房屋建筑面积来置换了这合理吗?