购二手房法律咨询

目前考虑通过中介购买一套二手房，房屋情况是有商业贷款和公积金贷款。中介说：房主需要用我们的首付款还清贷款，然后办理过户，必要的话可以进行公证。我们没有经验，想咨询的是，如果我们签了三方协议，然后有公证处的公证，房主用我们的首付去还清贷款后再办理过户是否可行？如果房主拿到首付款后“消失”了，我们该怎么办？