国有土地的房产证,房管局却说该小区土地被法院扣押,不能办过户和抵押等任何手续,咋办?

我有一房产，2000年办的房产证，土地性质国有，近期告知，房产所在一片小区2001年被法院扣押，所以不能办理任何抵押，过户等手续。我找房产局，他们答复国土局的档案是注明给法院查扣，说明土地有问题当然不能办理过户抵押等相关业务啦。他们说是当时开发商的原因。请教一下，这算怎么回事？我们要找那个部门、怎么办？谢谢