请问这种交税比率合理合法吗?我这套商品房到底是算第二套房?还是第三套房?

本人在乡下镇街上自建一栋三层楼房,一楼为门市,二层、三层为住宅,共322平米,现在县城里买了一套80平米的商品房,交契税时,说我那自建房第二层及第三层各算一套房(整栋房只有一个