国家建设地土征收资补当事人同一单位一方能有证一方则无法取证,但双方单位并非两家请问象这种纠纷应怎样断才公理?

国家建设地土征收资补当事人同一单位一方能有证一方则无法取证,但双方单位并非两家,有证据的只一家,有证据方还为原告,请问象这种纠纷应怎样断才公理?