建房子是按一楼地基还是按2楼地基算面积

按总面积!因为这是房产(所有权)证,地基面积只是和土地(所有权)有关。

三层楼房,每层100平米,房产证上就是300平米。

看来你不懂房屋建筑,还是找专业人士给看看吧。两层建筑已经不能随便了。1,基础应该根据上面的荷载和地基土的地质强度来计算的,2,基础埋深还要超过冻融深度,并且任何情况下不小于500mm埋深。室内外高差一般300mm,但你做1m高差也可以,这个根据你的需要来。具体没有你的资料,不好乱说。