房产证和土地证二合一后如何办理?

今年年初买了套房子，房主有土地证和房产证，在过户过程中，先进行登记查询，后来房管局工作人员告知，土地证不属于同一宗地，所以不能办理过户，请问遇到这种问题后怎么才能过户？