这样房屋抵押协议有效吗?

我一个朋友想向我借钱，说好了到时候没还上就把自己的房子抵押给我，我想和他签订一个协议。问题是，他的房子是我们单位的房改房，只有房产证，没有土地证，而我们单位又把土地证拿到银行去抵押了，这份协议要怎样写才能维护我的权益呢？我们签订的协议有效吗？公证处会给我们这个协议做公证吗？