办理老房子的房产证(已有一套商品房)

我家去年向村里申请住房，理由是孩子大了，住房不够。村里最后批下来，是一套商品房。现在房子也已经在建了。可是我们现在想把现在居住的老房子的房产证也批下来。老房子原来是一处三无用基，应该是村里的。但是我们十几年前就建在上面，当时有人来拆。商谈下来说罚款几万就可以办。可是那时候没钱，就压下来了。现在想办，应该怎么办？