一间店铺怎么样分成两个房产证?

拆迁还建的房屋，有一临街的店铺，由于拆迁时原店铺面积不大，所以在还房时把一间较大的店铺隔成两间店铺。其中一间面积较小不好出租，能否把间隔的砖结构墙打掉，换成木工板？（两间店铺不是一家人所有的）会不会有什么问题？