关于办理房产证和契税的问题

我第一套房子是单位的房子，现在已经全额付款买了，但是房产证单位一直没有给办理下来呢，后来又买了套商品房，应该算是第二套房子了吗？现在后来买的房子听说要交契税，我不懂什么意思，第二套房子是办理的分期付款，还在还款中。这个契税到底怎么算呢？请教专家说明下。