咨询要求单位补差公积金问题

1本人于2009年6月入职中兴通讯，入职地为深圳，最初的三年公司给缴的公积金在广州（2011年转到深圳的），2011年我当时不知道未足额缴纳，遂因转到深圳就全部取出来了，现在这种情况是否还可以申请公司补差。2公司注册地和我的入职地点都是深圳。我应该去广州住房公积金哪个分部去办理？还是说任一分部都可以通办。感谢