这类性质的房屋究竟怎么进行拆迁处理?

我父亲是退休军人,响应**军委39号文件回农村买地建房,由于历史遗留的种种原因没有相关证件,现遇拆迁,请问补偿后土地使用证的权属性质和拆迁政策是怎么样的?谢谢!