想问一下当时私下制定的房屋转让协议是否有效?甲是否能将房屋收回,办理拆迁??

3月甲将单位的公有房以一万元的价格转让给乙,双方在私下制定转让协议并签订了该协议,但当时乙未将房屋过户,所有房屋相关证明都在甲处。现在房屋要拆迁,在08年3月甲已经将该公有房从单位买入,想进行拆迁办理。但是乙坚持该房属于他所有,所以拆迁办理无法进行。