我于2004年取得国有土地使用权,并办理建筑I工程规划许可证和国有土地改建审批单请问我施工造成的损失找哪个部门评估才有法律效力?

既然是依法开发,就应当具备相应手续。如果有人故意阻挠你开发,你应当收集保存好证据,然后提起诉讼,大概估算一个损失去立案。在法院立案开庭审理过程中,再对损失情况进行具体评估。这是正确渠道。