我的宅基地,土地证面积不符,实质面积小,土地证的面积大一百多个平方他这样做合法吗?

你好律师,我的宅基地,土地证面积不符,实质面积小,土地证的面积大一百多个平方,我父亲拿证到当地的土地所,给我们哥俩分户,叫土地所的人把4个土地证的,其中一个(100多个平方)给扣留了。我去要证,他不给说作废了,他这样做合法吗?