违章建筑界定

我们家于2006年建成一占地面积111.2平方米的两层楼房,当初建造时,我家去土管办申请产权证时被告知产权证已不再审批,后来经过村委会和乡政府前来测量面积并交了六千元的建筑清理费后允许我家房屋建造,近日因拆迁,与拆迁办赔偿条件不能达成一致后,就说我家房屋为违章建筑,责令整改,因此我想知道我家房屋到底属于什么性质,是否合法?