无凭无证的土地纠纷

本人申请一桩宅基地,手续也已办好批了,到了镇国土所.所里扣留称有反咉该地是他家的,国土所的工作人员到村里了解证实此人所说是该地块解放前是他家的,无凭元证,58年土改全部变为村集体所有.国土所要求要处理好这件糾纷,手续才能给我,请问若没处理好,该手续会不会作废