我家要盖二层的楼房 ,后面留三米的后院,可后邻拦着

你盖楼房会不会影响后院的采光呢，如果你说的留门留窗是指留后门窗的话，后院可能是担心你们家人可以随便进出他的庭院，建议你与后院再协商一下，确认不会对他们造成不利影响，相信他们如果不是不讲理的人就不会再阻挠。

协商不成， 建议及时走法律途径解决，以获得合法、合理的解决。

建议协商，协商不成可以向法院起诉