请问考大学的研究生好还是研究所的研究生好

我是核专业的,想考西安交大的研究生,但是西安还有一些核方面的研究所,请问报哪一个好一些啊,请帮我分析下嘛,如果考高校研究生不上,可不可以调到指定研究所?