二手房不够5年缴税和房管所评估问题

我在佛山黄岐买不过5年的二手房平方，去申请缴税的时候我们写的评估件是5300元一方，但是现在银行评估出来的价是7490元一方。那我要缴税按银行评估出来的税数，但是发票为什么开的纳税数额我们是按我们自己评估的5300元一方来开？那还剩下2490元一方纳税是没有发票，我想问问为什么剩下的就不给我开票呢？