商品房开发公司不同意签国家标准合同,只同意签他们公司订的合同怎办??

不买。

这样的公司肯定没有合法手续，没有商品房预售许可证，否则不会没有格式合同，这样公司自行拟定的合同没有办法登记备案，没有登记的合同没有法律效力，根本不生效，只有合同经过登记才生效的唯有房屋买卖合同。