房屋被房产证借名人与政府签订协议,尽管征收过程中房屋利害关系人一再与政府表明此屋权具有争议还能打确权官司吗?

房屋被房产证借名人与政府签订协议,尽管征收过程中房屋利害关系人一再与政府表明此屋权具有争议,仍被政府强行收购,还能打确权官司吗?