农村房屋面积是否算院子面积

请问我是农村老房拆掉盖的新房,按土地使用证上的面积是140个平方,房屋建成后按测量面积算才130多个平方,结果办理房产证时,人家测量把我家院子也和房屋一起测量,结果有180多个平方,他们就要按超面积罚款,请问测量院子也算吗?我家院子在村级公路边,按理说公路里3米就不应该算我的房屋面积呀 。