我住海珠石溪村,现在进行城中村改造,只有宅基地使用证副本怎样得到应有的赔偿的?

因为当时大楼改建小套间出售,分摊面积改变,住户没去面积核准审计,以至于后来集体房产证没办理成功,办成了宅基地证,但宅基地证正本也不在住户手上。现城中村改造,要怎么手续办才不亏?