87年农村盖2层楼房,使用证标图只显示一层,现评估单位按一楼有证算,二楼按临建算请问我这二楼应该怎么算?

87年农村盖2层楼房,使用证标图只显示一层,现评估单位按一楼有证算,二楼按临建算,请问我这二楼应该怎么算,找哪个部门申诉。