我想在自己宅基地上盖三层楼,我想问问二三楼留后窗户多大距离才不对后面邻居有影响

这是需要规划审批的,冬至日光照2个小时是最低要求,所以需要测算。不是说你满足了距离要求就可以建房,而是按规划审批的要求建房才是合法合理的。