国有土地征收房屋评估时,只评估房屋不评估房屋所占国有土地吗?

我家的房屋因为在房改前就是在被征收的国有土地上,在进行这次房屋征收评估时,只评估了房屋,没有评估房屋所占的国有土地,征收实施单位说是国有土地,房屋所占国有土地只是收回,这直接导致我在进行产权房屋置换时多出土地使用费,请问这合法吗?我应该如何维护自己的权益?