家里盖房子,向住建局递交的申请是盖三层,当时家里人和住建局局长都签了字怎么处理比较妥当?

家里盖房子,向住建局递交的申请是盖三层,当时家里人和住建局局长都签了字,但这份文件只有一份,由住建局保管,过了几天,现在住建局拿出那份文件后面备注的说是盖两层,不让盖三层,这种情况属于什么案件?怎么处理比较妥当?