房屋产权违约如何赔付

您好,我们是公积金贷款买房。因为开发商一直没有办理房屋产权登记而起诉。根据《商品房买卖合同》关于产权登记的约定中,出卖人应该按已付房款的1%赔付违约金。我想咨询下,这个已付房款是我们已经交了的首付款项 还是首付款和已和银行办理贷款的总房价。我们公积金贷款已经有两年五个月。