原来同一个老板有一个厂房,有一个酒店,两本土地证两本房产证;土地相连的没房产证的部分有保障吗?

原来同一个老板有一个厂房,有一个酒店,两本土地证两本房产证;土地相连的,我通过法院拍卖买了酒店,房产及附属房,评估报告里都有,法院公告也有,根据现状买的,没房产证的部分有保障吗?整幢的房子一部分在工厂土地证,请问没房产证的部分怎么办