编程高手们请帮忙

我最近用C＃.net 写了个程序，其中一个模块运行需要的时间最大时需要二三十分钟，其中的原理是用一段string 与sql server 2000数据库中几千个记录的ntest类型的字段进行比较，我知道这么做一定会耗费很多时间，但是这也太长了，请问各位程序运行速度与什么有关？怎样才能优化程序以提高速度？谢谢了