有些内容在初期的投资协议书签订中是有明确说明的,但是在公司章

有些内容在初期的投资协议书签订中是有明确说明的,但是在公司章程中没有相关的说明,那么出现纠纷的时候能否依据投资协议书来?例如绩效奖励和利润补偿原则这些问题在投资协议书中有明确说明,但是在公司章程中只是说利润分配按出资比例分配。