甲公司业务员将合同版本拟订好,

甲公司业务员将合同版本拟订好，经领导审批，办理了本公司合同章签章，寄给乙公司，并且要求对方签章后寄回，之后却忘记主动追回，导致未能拿到乙公司签章确认的合同。乙公司在合同的“其他约定事项栏”中添加了关于违约责任的手写条款，双方后来就欠款和违约金方面发生争议，最后法院按照合同判乙公司胜诉。请问甲公司为何败诉，有哪些法律依据？