在京中央机关住房问题

我父从一北京中央事业单位退休，正处级，教授级高工。98年腾退一个8平米混居换为20平的混居租住。我母90年代初从单位按有异性大子女的条件分得一套90平三居。并于98年以成本价购买。但我父单位以此为理由认为我父住房已经超标，拒绝我父希望换成独立单元房请求。请问单位这样作合理吗？依据是什么。如果不合理，我应如何与之协商