两个户口注销了一个,有房产按揭怎么办房产证

我原来是是农业户口，后来在城里上班又买了个户口，就这样一直两个户口，也没管，后来在聊城按揭买了一套房是用农业户口办的，但是这个户口在2014年给注销了，现在办房产证呢，一查不行，请问这个手续能变更成现在非农业的吗？