关于重建房房产证的疑问（来自菏泽宅基地小区）

你好！我想求教一下，我家的土地证是50年代市政府发的，划分给的宅基地。我们都是城市户口。三层的老房子，前几年补办了房产证。因为很久没有修过，现在成危房了。前段时间给拆了重新建了四层，超过了原来的建筑面积，但是土地证上的面积没超。现在要办理房产证的话应该如何办理呢？怎么样办理才能最省钱呢？