通过中介买了套二手房,房产证过户了,拿去银行做抵押了,随后去办理土地证

通过中介买了套二手房，房产证过户了，拿去银行做抵押了，随后去办理土地证变更登记，正好赶上国家出新政策《双证合一》。国土资源局不给单独变更土地证，必须把房产证和土地证收回，出一个不动产证。银行不让收回，除非还清贷款。我想问一下，这样的情况怎么办，如果土地证不变更，会有什么影响。